喷雾干燥是个连续生产的过程，控制点比较多。比如密闭循环系统的控制点包括：进料浓度、进料速度、进风速度、进风温度、系统压力、各部件压差、气体纯度检测等等，依靠传统的手动调节非常困难。一套好的自动控制系统，可以使整个喷雾干燥系统运转顺畅，降低产品的不合格率，减少安全隐患。

喷雾干燥效果，由于口服原料药还需要进一步完成制剂工艺，在提高制剂效果和终药品的服用吸收效果方面，对喷雾干燥产品的物理性质提出不同的要求。首先，水分含量是干燥产品的指标，一般要求控制在一定的范围，不能过高或过低。其次，药物的分装一般按照体积来控制装量，这就要求产品的堆密度稳定，产品的流动性要好。口服冲剂则往往要求速溶性。一般说来，改变雾化的分散度或适当改变操作条件以控制干燥速率，可以制得具有不同堆密度的产品，但变化的幅度是有限的。在改善物性方面值得一提的一种技术是泡沫喷雾干燥，即将进料液体先泡沫化后再行喷雾干燥。该方法初是为提高热效率而提出的，后来用以调整产品的物性。现已证明，泡沫喷雾干燥制得的产品粒径大、多孔、多凹陷、表面粗糙，具有良好的速溶性。另外，口服原料药还会有一些特殊的要求，比如：颗粒形状。有的要求球形颗粒，颗粒大小均匀。一般来说，通过改变雾化方式，可以得到不同形状的颗粒。原料药、中药厂家在选择喷雾干燥机之前，在设备制造企业的协助下，进行参数优化的实验，以确定一个理想的参数组合，确保喷出药品的干燥效果